Berikut ini Rencana Kerja dan Anggaran (RKA) SKPD Tahun Anggaran 2021:
- Dinas Pendidikan dan Kebudayaan
- Dinas Kesehatan
- RSUD Dr. H. SLAMET MARTODIRDJO
- RSUD Waru
- Dinas Pekerjaan Umum dan Penataan Ruang
- Dinas Perumahan Rakyat dan Kawasan Permukiman
- Satuan Polisi Pamong Praja dan Pemadam Kebakaran
- Badan Penanggulangan Bencana Daerah
- Dinas Sosial
- Dinas Pemberdayaan Perempuan dan Perlindungan Anak serta Pengendalian Penduduk dan Keluarga Berencana
- Dinas Ketahanan Pangan dan Pertanian
- Dinas Lingkungan Hidup
- Dinas Kependudukan dan Pencatatan Sipil
- Dinas Pemberdayaan Masyarakat dan Desa
- Dinas Perhubungan
- Dinas Komunikasi dan Informatika
- Dinas Koperasi, Usaha Kecil dan Menengah
- Dinas Penanaman Modal, Pelayanan Terpadu Satu Pintu dan Tenaga Kerja
- Dinas Kepemudaan, Olahraga dan Pariwisata
- Dinas Perpustakaan dan Kearsipan
- Dinas Kelautan dan Perikanan
- Dinas Perindustrian dan Perdagangan
- Sekretariat Daerah
- Sekretariat DPRD
- Badan Perencanaan Pembangunan Daerah
- Badan Pengelolaan Keuangan dan Pendapatan Daerah
- Badan Kepegawaian dan Pengembangan Sumber Daya Manusia
- Inspektorat Daerah
- Kecamatan Pamekasan
- Kecamatan Tlanakan
- Kecamatan Proppo
- Kecamatan Pademawu
- Kecamatan Galis
- Kecamatan Larangan
- Kecamatan Palengaan
- Kecamatan Pegantenan
- Kecamatan Pakong
- Kecamatan Waru
- Kecamatan Batumarmar
- Kecamatan Pasean
- Kecamatan Kadur
- Badan Kesatuan Bangsa dan Politik